Contents of Report


[Data of Report]

Report Number:
TR0902
Date of Registration:
1995.01
English Title:
***
Japanese Title:
並列計算機を用いたタンパク質の配列のアライメント解析
English Author:
M.Ishikawa
Japanese:
石川 幹人
Name of Organization to which author belongs:
***
PDF:
tr0902.pdf

[Contents]

1緒論.... 9
1.1タンパク質配列のアライメント解析.... 9
1.2従来のアライメント解析技術.... 15
1.3本研究の位置付け.... 27
2並列シミュレーテッドアニーリングによるアライメント.... 30
2.1並列シミュレーテッドアニーリングのアルゴリズム.... 30
2.2マルチプルアライメントへの適用.... 33
2.3実験と結果.... 37
2.4考察.... 45
3並列反復改善法によるアライメント.... 49
3.1反復改善法によるアライメント.... 49
3.2反復改善法の並列化.... 51
3.3限定分割法の導入.... 58
3.4考察.... 65
4並列遺伝的アルゴリズムによるアライメント.... 70
4.1遺伝的アルゴリズム.... 70
4.2マルチプルアライメントへの適用.... 73
4.3実験と結果.... 77
4.4考察.... 82
5並列アライメントのワークベンチ.... 85
5.1従来のアライメントワークベンチ.... 85
5.2本ワークベンチの基本概念.... 86
5.3本ワークベンチの使用法.... 88
5.4考察.... 94
6立体構造を考慮した並列アライメントシステム.... 97
6.1立体構造とアライメント.... 97
6.2ステム構造を考慮したアライメント法.... 99
6.3実験と結果.... 102
6.4考察.... 107
7結論.... 110
7.1研究成果の要約.... 110
7.2将来への展望.... 113
7.3研究成果の公表.... 114
7.4謝辞.... 116
End.... 129


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